Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kcnf1Q7TSH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kcnf1Q7TSH7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kcnf1Q7TSH7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kcnf1Q7TSH7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms