Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms