Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp3Q7TNH6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp3Q7TNH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp3Q7TNH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Nphp3Q7TNH6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp3Q7TNH6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms