Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpf1Q7TND5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpf1Q7TND5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpf1Q7TND5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpf1Q7TND5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms