Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ipo8Q7TMY7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ipo8Q7TMY7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ipo8Q7TMY7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ipo8Q7TMY7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ipo8Q7TMY7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ipo8Q7TMY7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ipo8Q7TMY7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ipo8Q7TMY7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ipo8Q7TMY7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms