Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ScocQ78YZ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
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