Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcl2Q78Y63 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcl2Q78Y63 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms