Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim12Q78RX3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms