Protein–RNA interactions for Protein: Q78JE5

Fbxo22, F-box only protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo22Q78JE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo22Q78JE5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo22Q78JE5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo22Q78JE5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo22Q78JE5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo22Q78JE5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo22Q78JE5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms