Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ssh1Q76I79 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh1Q76I79 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh1Q76I79 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh1Q76I79 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms