Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp34Q6ZQ93 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp34Q6ZQ93 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp34Q6ZQ93 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp34Q6ZQ93 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms