Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Efr3bQ6ZQ18 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Efr3bQ6ZQ18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efr3bQ6ZQ18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms