Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GcsamQ6RFH4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GcsamQ6RFH4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GcsamQ6RFH4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms