Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca4aQ6Q473 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clca4aQ6Q473 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clca4aQ6Q473 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca4aQ6Q473 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca4aQ6Q473 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clca4aQ6Q473 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca4aQ6Q473 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clca4aQ6Q473 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca4aQ6Q473 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms