Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfrkbQ6PIJ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfrkbQ6PIJ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfrkbQ6PIJ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfrkbQ6PIJ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms