Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx13Q6PHS6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx13Q6PHS6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx13Q6PHS6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms