Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc57Q6PHN1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc57Q6PHN1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms