Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmeff1Q6PFE7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmeff1Q6PFE7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmeff1Q6PFE7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmeff1Q6PFE7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms