Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SvoplQ6PDF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SvoplQ6PDF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SvoplQ6PDF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms