Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAK3

Prmt8, Protein arginine N-methyltransferase 8, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt8Q6PAK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prmt8Q6PAK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prmt8Q6PAK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prmt8Q6PAK3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prmt8Q6PAK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prmt8Q6PAK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prmt8Q6PAK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prmt8Q6PAK3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prmt8Q6PAK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prmt8Q6PAK3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prmt8Q6PAK3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms