Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc148Q6P5U8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc148Q6P5U8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc148Q6P5U8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms