Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nsd3Q6P2L6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nsd3Q6P2L6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nsd3Q6P2L6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nsd3Q6P2L6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Nsd3Q6P2L6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nsd3Q6P2L6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsd3Q6P2L6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nsd3Q6P2L6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms