Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm2bQ6P1G2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm2bQ6P1G2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm2bQ6P1G2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms