Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HelbQ6NVF4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HelbQ6NVF4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HelbQ6NVF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HelbQ6NVF4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms