Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc66Q6NS45 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc66Q6NS45 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms