Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Edrf1Q6GQV7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Edrf1Q6GQV7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Edrf1Q6GQV7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Edrf1Q6GQV7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Edrf1Q6GQV7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Edrf1Q6GQV7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Edrf1Q6GQV7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Edrf1Q6GQV7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms