Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ScapQ6GQT6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ScapQ6GQT6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ScapQ6GQT6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms