Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnna3Q65CL1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnna3Q65CL1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms