Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprdQ64487 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprdQ64487 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprdQ64487 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms