Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tm4sf1Q64302 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tm4sf1Q64302 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tm4sf1Q64302 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm4sf1Q64302 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tm4sf1Q64302 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tm4sf1Q64302 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tm4sf1Q64302 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tm4sf1Q64302 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tm4sf1Q64302 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms