Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2kQ63871 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr2kQ63871 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms