Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zic2Q62520 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zic2Q62520 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zic2Q62520 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zic2Q62520 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms