Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vil1Q62468 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vil1Q62468 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vil1Q62468 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vil1Q62468 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms