Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vat1Q62465 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vat1Q62465 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vat1Q62465 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms