Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp1Q62442 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp1Q62442 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp1Q62442 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms