Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ss18Q62280 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ss18Q62280 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Ss18Q62280 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms