Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SypQ62277 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SypQ62277 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SypQ62277 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SypQ62277 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SypQ62277 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SypQ62277 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SypQ62277 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SypQ62277 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SypQ62277 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SypQ62277 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SypQ62277 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SypQ62277 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SypQ62277 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SypQ62277 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SypQ62277 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SypQ62277 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SypQ62277 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SypQ62277 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SypQ62277 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SypQ62277 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SypQ62277 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SypQ62277 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SypQ62277 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SypQ62277 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SypQ62277 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SypQ62277 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SypQ62277 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SypQ62277 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SypQ62277 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SypQ62277 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SypQ62277 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms