Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SnrpcQ62241 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SnrpcQ62241 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpcQ62241 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpcQ62241 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms