Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sycp1Q62209 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sycp1Q62209 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Sycp1Q62209 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sycp1Q62209 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms