Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4bQ62179 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4bQ62179 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4bQ62179 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4bQ62179 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms