Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Odf1Q61999 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms