Protein–RNA interactions for Protein: Q61967

Zfp90, Zinc finger protein 90, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp90Q61967 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp90Q61967 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp90Q61967 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp90Q61967 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp90Q61967 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms