Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3Q61817 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Creb3Q61817 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3Q61817 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms