Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LbpQ61805 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LbpQ61805 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbpQ61805 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LbpQ61805 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbpQ61805 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbpQ61805 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LbpQ61805 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LbpQ61805 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbpQ61805 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbpQ61805 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LbpQ61805 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137 ms