Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga7Q61738 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Itga7Q61738 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga7Q61738 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms