Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msi1Q61474 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msi1Q61474 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Msi1Q61474 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi1Q61474 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms