Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna2Q61301 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna2Q61301 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna2Q61301 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna2Q61301 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna2Q61301 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna2Q61301 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna2Q61301 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna2Q61301 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna2Q61301 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna2Q61301 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms