Protein–RNA interactions for Protein: Q61092

Lamc2, Laminin subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc2Q61092 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamc2Q61092 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc2Q61092 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc2Q61092 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamc2Q61092 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc2Q61092 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc2Q61092 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc2Q61092 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms