Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HellsQ60848 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HellsQ60848 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HellsQ60848 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HellsQ60848 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HellsQ60848 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HellsQ60848 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HellsQ60848 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HellsQ60848 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms