Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SkiQ60698 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SkiQ60698 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SkiQ60698 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SkiQ60698 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SkiQ60698 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SkiQ60698 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SkiQ60698 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SkiQ60698 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms